掌握忍法与卷轴的使用技巧是提升实战能力的关键，其核心在于根据忍者特性与战斗场景进行精准搭配。秘卷系统作为忍者的独特技能，主要分为攻击型、防御型和辅助型三大类，选择时需首先匹配忍者类型：爆发型忍者适合携带查克拉等刷新技能或强化输出的秘卷；消耗型忍者则推荐使用气旋、冻雪等用于控制距离和限制走位的秘卷；反手型忍者依赖霸体来免疫控制实现反击，而生存型忍者则可选择扦插之术来限制对手行动。对战场景也是重要考量，竞技场中多选用气旋、查克拉等功能性秘卷，而在副本或组织战中则可直接使用豪火灭却等高伤害秘卷来提升清怪效率。
通灵术作为重要的战术支援手段，其使用时机与技能效果紧密相连，力求在关键时刻扭转战局。蓝蛇的毒沼技能可以在敌人比较集中的时候使用，以造成大范围伤害并遗留持续毒性效果；面对高伤害的BOSS时，使用能提供防御加成并造成高额伤害的镰鼬转转舞则是明智的选择。通灵兽的技能不仅能直接打击敌人，还能为整个小队提供攻击力、防御力或移动速度等增益效果，因此把握释放时机，使其与战局和队友状态相配合，才能将收益最大化。
实战中的基础操作技巧深刻影响着战斗节奏与技能命中率。释放技能时需要掌握不同忍者的技能前摇时间，避免在关键帧被敌人打断。在面对难以精准预判对手位置的局面时，选用攻击范围较大的忍者或技能可以有效避免攻击落空和技能浪费。在技能使用策略上，不应一味积攒奥义点，适时释放大招不仅可以打乱对手节奏，有时还能起到决定性的作用。通过观察敌人的攻击模式并保持灵活走位，是在复杂战局中生存并寻找反击机会的基础。
秘卷的运用策略需要更加精细和具有针对性，其强弱并非绝对，更取决于使用时机。冻雪这类强控场秘卷最好等待对手交出替身术后再使用，以确保控制有效；而霸体秘卷则适合在预判对手即将发动反打攻势时开启，以抵消控制效果。了解不同秘卷的优势与克制关系，例如利用气旋秘卷来打断敌人的突进技能，或使用解术散来反制对手的霸体状态，是高水平对决中的重要博弈点。
资源获取与战力成长同样离不开对各类系统机制的了解与利用。冒险模式是提升战力和获取资源的核心途径，通过三星通关剧情关卡可以获得天赋点。每日完成活跃度任务、参与小队突袭并开启三倍奖励、以及挑战修行之路至当前极限关卡，都是稳定获取金币、忍玉和声望等珍贵资源的重要手段。加入一个活跃的组织不仅能参与团队活动，还能在商店中兑换忍者碎片和强化道具，这对于长期发展至关重要。
除了秘卷和通灵术，替身术等基础忍术的合理运用也是高阶技巧的一部分。替身术能够在受到攻击后移形换位，是脱离连招和发起反击的关键。使用替身术的核心思路是以闪避和创造机会为主，通常不建议在替身后立即进行原地反击，因为对手也可能使用替身术进行反制，更稳妥的做法是先行拉开距离，重新寻找切入时机。在团队配合中，替身术还能用于快速支援队友或与队友的技能形成合击。替身术需要消耗奥义点并具有冷却时间，因此需谨慎判断使用时机，避免在真正危急时无法使用。
